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α4β7抗体无法用于治疗猴免疫缺陷病毒感染|“小柯”论文速递
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科学网2019.9.6我要分享

“小柯”是由中国科学院和北京大学高层科研团队开发的科学新闻写作机器人。它旨在帮助科学家们快速获得世界上高级中文英语论文的最新科学研究进展。

《科学》:第365卷第6457期

●α4β7抗体不能用于治疗猴子免疫缺陷病毒感染

哈佛医学院的Dan H. Barouch研究小组最近发现,α4β7抗体对感染SIVmac251病毒的恒河猴缺乏治疗作用。相关论文于2019年9月6日发表在[6x9A8B]上。

据报道,在停止抗逆转录病毒疗法(ART)后,持续控制1型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)感染的病毒是HIV-1治疗领域的主要目标。

最近的一项研究报道,抗α4β7抗体可在恒河猴中长期控制病毒,这些恒河猴被100%含有nef基因终止密码子的减毒猿猴免疫缺陷病毒(SIV)感染。

研究人员对50只感染了野生型SIVmac251病原体的恒河猴进行了类似的研究。

在急性或慢性感染期间开始抗病毒治疗的动物中,注射抗a4p7抗体对ART停止后的病毒复苏或病毒反弹没有可检测的作用。

这些数据表明抗-α4β7抗体的施用在恒河猴的致病性SIVmac251感染模型中没有提供治疗功效。

相关论文信息:

●珊瑚同时产卵可能会导致灭绝

以色列特拉维夫大学的尤西洛亚(Yossi Loya)小组发现,珊瑚以同步的方式产卵,威胁着其种群的生存。相关论文发表在2019年9月6日发布的《科学》上。

他们量化了四个繁殖季节珊瑚产卵的强度,并对息肉,种群和种群水平进行了实验分析,并证明与历史数据相比,红海中的几种物种已经失去了繁殖同步性。

最终,这种同步性的破坏降低了成功受精的可能性,并导致缺少新成员,这可能导致群体老化甚至灭绝。

可以理解,对珊瑚礁的人为干扰和自然干扰通常通过可见的破坏(例如,由于漂白事件造成的珊瑚漂白)来量化,但是环境条件的变化也可能以不太明显的方式对其造成伤害。

尽管当前的范例表明发生了一致的,高度同步的产卵事件,但通过播种繁殖的珊瑚特别脆弱,因为其繁殖物候受到环境因素的影响。

相关论文信息:

●合成生物学中的“剪刀布”规则

加利福尼亚大学圣地亚哥分校的杰夫哈斯提(Jeff Hasty)团队最近进行的一项研究使用剪刀石布的原理开发了工程化的种群动态,从而增加了遗传稳定性。相关论文发表在2019年9月6日发布的《科学》上。

研究人员使用了一种以生态相互作用为指导的互补方法来设计循环种群控制,以稳定细胞内基因环的功能。

研究人员设计了三种大肠杆菌菌株,以便每种菌株都可以杀死或被另外两种菌株之一杀死。

如此获得的“剪刀-石布”动态地反映了微流体装置中菌株的快速循环,并增加了细胞培养中基因环功能的稳定性。

研究人员说,合成生物学的进步已经产生了一系列概念验证的细菌环,可用于从治疗到生物生产的各种应用。

对于大多数应用,同样的挑战是选择压力的存在,这会导致工程菌的突变率增加。

一种普遍的策略是开发旨在增加单个细胞中有害突变固定时间的克隆技术。

相关论文信息:

●大肠杆菌结构鉴定

耶鲁大学的Jason M. Crawford和Seth B. Herzon研究小组已合作阐明大肠菌素的结构及其与DNA的共存关系。该结果发表在2019年9月6日发布的《科学》中。

研究人员使用遗传学,同位素标记,串联质谱和化学合成来推断大肠菌素的结构。

分析师分析的结构分析解释了所有已知的生物合成和细胞生物学数据,并提出了未知酶在大肠菌素基因簇中的作用。

研究人员表明,大肠菌素是由某些遗传毒性肠杆菌产生的复杂的次级代谢产物。

产生大肠杆菌的细菌的存在与人类大肠癌的发生频率和严重程度有关。

但是,由于尚未分离或分离出大肠菌素,因此很难研究产球菌的细菌在人肠道中的生理作用。

相关论文信息:

●评价控制SIV感染的α4β7抗体的滴度

美国国立卫生研究院的M.Di Mascio小组最近进行的一项研究评估了猴免疫缺陷病毒(SIVmac239-nef-stop)被α4β7抗体感染的情况。这项研究已于2019年9月6日发表在国际学术期刊《科学》中。

据报道,用短期抗逆转录病毒疗法(ART)和部分重叠的抗整合素α4β7输入治疗的SIV感染的恒河猴可以诱导治疗后的长期病毒抑制。

为了复制这些观察结果,研究人员用相同的病毒,相同的ART和单克隆抗体(mAb,抗α4β7与对照mAb相比)处理了感染的猕猴。

测序表明所使用的病毒实际上是SIVmac239-nef-stop,而不是野生型SIVmac239。

感染后2周,发现减毒的Nef-STOP病毒对病原体Nef-OPEN的修复频率与血浆SIV RNA水平呈正相关。

在所有治疗中断后,血浆病毒血症水平和α4β7的高表达,以及首次进入抗体之前的CD4阳性T细胞(未用α4β7抗体治疗)的感染前水平与病毒复制水平相关。

随后的血浆病毒血症,外周血CD4阳性T细胞计数以及淋巴结和直肠组织病毒载量在抗a4p7和对照组mAb组之间无显着差异。

相关论文信息:

《科学》

●CRISPR介导的实时成像技术,用于基因组编辑和转录。斯坦福大学颜磊研究小组开发了一种实时成像工具,用于crispr介导的基因组编辑和转录。研究结果于2019年9月5日在线发布《科学》。他们报道了一种强大的通用工具crispr活细胞荧光原位杂交(livefish),它使用荧光寡核苷酸在包括原代细胞在内的多种细胞类型中进行基因组追踪。crispr-directed rna的内在稳定性使活体鱼能够准确检测染色体异常,如产前羊水细胞中的patau综合征,并追踪人类t淋巴细胞中的多个位点。此外,livefish还追踪了crispr-cas9介导的编辑和随后的染色体易位引起的dna双链断裂的实时动态。最后,结合cas9和cas13系统,livefish可以在活细胞中同时显示基因组dna和rna转录本。livefish方法能够在单细胞基因组编辑、转录和重排过程中实时成像dna和rna。

相关纸张信息:

《科学》:第178卷第6期

●研究发现肠道菌群对抗体反应的影响

抗生素引起的肠道菌群紊乱已经改变了人类对疫苗的免疫力。这个结果是由斯坦福大学的巴厘-普兰德兰研究小组得出的。相关论文于2019年9月5日在《细胞》发表。

研究人员在季节性流感疫苗接种前后对健康成人使用广谱抗生素。虽然肠道细菌负荷减少了倍,细菌多样性继续下降,但抗体反应没有受到明显影响。

但是,在第二项试验中,抗体滴度较低的受试者中,H1N1特异性中和和结合IgG1和IgA反应明显受损。

此外,在这些研究中,抗生素治疗还导致:

(1)老年人的炎症特征(包括AP-1/NR4A表达)增加,树突状细胞激活增加;

(2)不同的代谢轨迹,血清次生胆汁酸减少了1000倍,这与AP-1/NR4A信号传导和炎症体激活高度相关。

多组学整合揭示了细菌物种与代谢表型之间的重要联系,突显了微生物组在调节人类免疫力中的关键作用。

据报道,新出现的证据表明微生物组在免疫中具有重要作用。但是,人类的因果证据很少。

相关论文信息:

●淀粉样蛋白组装激活磷酸酶活性

果蝇胚胎发育中的淀粉样蛋白组装与磷酸酶的活化有关,磷酸酶的活化是美国Stalls医学研究所的Kausik Si研究小组获得的。研究结果发表在2019年9月5日发布的《细胞》上。

研究人员通过果蝇果蝇的多模式筛选鉴定了screening病毒蛋白Herzog(CG5830)。

Herzog充当膜相关的磷酸酶并控制胚胎模式,可能参与TGF-β/BMP和FGF/EGF信号通路。

值得注意的是,Herzog单体没有酶活性,在淀粉样蛋白组装后变得有活性。

Herzog的病毒样结构域对于其组装和膜定位至关重要。

mov病毒样结构域的去除影响活性,而异源病毒样结构域的使用恢复了膜上的装配,并且膜定位的基序能够恢复磷酸酶活性。

这项研究提供了一个a病毒样结构域研究的例子,该研究允许酶通过淀粉样蛋白组装获得基本功能,从而控制动物的发育。

已知病毒蛋白可以在同一细胞中表现出不同的构象和物理状态。序列分析表明病毒蛋白样蛋白在各种物种中普遍存在。然而,它们在多细胞生物中的功能尚不清楚。

相关论文信息:

●研究发现CRISPR转录的关键抑制剂

加拿大多伦多大学的Alan R.Davidson团队发现,抗CRISPR相关蛋白是CRISPR转录的关键抑制剂。该研究报告于2019年9月5日发布在《细胞》上。

他们揭示了一种抗CRISPR蛋白(Acr)相关的启动子,该启动子在噬菌体DNA注射后立即驱动高水平的Acr转录,而抗CRISPR相关基因(aca)蛋白随后抑制了转录。没有aca活性,这种转录对噬菌体是致命的。

研究表明,在感染过程中积累足够量的Acr蛋白会抑制宿主细胞中现有的CRISPR-Cas复合物。 Aca蛋白的保守作用,或减弱Acr启动子转录的有害作用。

根据报道,噬菌体表达一种抗CRISPR(Acr)蛋白,该蛋白可抑制CRISPR-Cas系统,否则该系统会破坏其基因组。大多数Acr基因位于与反CRISPR相关的基因附近,该基因编码具有螺旋-转-螺旋-DNA结合基序的蛋白质。

aca基因的保守性已经成为鉴定Acr基因的标志物,但是尚未研究由这些基因编码的蛋白质的功能。

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“小柯”是由中国科学院和北京大学高层科研团队开发的科学新闻写作机器人。它旨在帮助科学家们快速获得世界上高级中文英语论文的最新科学研究进展。

《细胞》:第365卷第6457期

●α4β7抗体不能用于治疗猴子免疫缺陷病毒感染

哈佛医学院的Dan H. Barouch研究小组最近发现,α4β7抗体对感染SIVmac251病毒的恒河猴缺乏治疗作用。相关论文于2019年9月6日发表在[6x9A8B]上。

据报道,在停止抗逆转录病毒疗法(ART)后,持续控制1型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)感染的病毒是HIV-1治疗领域的主要目标。

最近的一项研究报道,抗α4β7抗体可在恒河猴中长期控制病毒,这些恒河猴被100%含有nef基因终止密码子的减毒猿猴免疫缺陷病毒(SIV)感染。

研究人员对50只感染了野生型SIVmac251病原体的恒河猴进行了类似的研究。

在急性或慢性感染期间开始抗病毒治疗的动物中,注射抗a4p7抗体对ART停止后的病毒复苏或病毒反弹没有可检测的作用。

这些数据表明抗-α4β7抗体的施用在恒河猴的致病性SIVmac251感染模型中没有提供治疗功效。

相关论文信息:

●珊瑚同时产卵可能会导致灭绝

以色列特拉维夫大学的尤西洛亚(Yossi Loya)小组发现,珊瑚以同步的方式产卵,威胁着其种群的生存。相关论文发表在2019年9月6日发布的《科学》上。

他们量化了四个繁殖季节珊瑚产卵的强度,并对息肉,种群和种群水平进行了实验分析,并证明与历史数据相比,红海中的几种物种已经失去了繁殖同步性。

最终,这种同步性的破坏降低了成功受精的可能性,并导致缺少新成员,这可能导致群体老化甚至灭绝。

可以理解,对珊瑚礁的人为干扰和自然干扰通常通过可见的破坏(例如,由于漂白事件造成的珊瑚漂白)来量化,但是环境条件的变化也可能以不太明显的方式对其造成伤害。

尽管当前的范例表明发生了一致的,高度同步的产卵事件,但通过播种繁殖的珊瑚特别脆弱,因为其繁殖物候受到环境因素的影响。

相关论文信息:

●合成生物学中的“剪刀布”规则

加利福尼亚大学圣地亚哥分校的杰夫哈斯提(Jeff Hasty)团队最近进行的一项研究使用剪刀石布的原理开发了工程化的种群动态,从而增加了遗传稳定性。相关论文发表在2019年9月6日发布的《科学》上。

研究人员使用了一种以生态相互作用为指导的互补方法来设计循环种群控制,以稳定细胞内基因环的功能。

研究人员设计了三种大肠杆菌菌株,以便每种菌株都可以杀死或被另外两种菌株之一杀死。

如此获得的“剪刀-石布”动态地反映了微流体装置中菌株的快速循环,并增加了细胞培养中基因环功能的稳定性。

研究人员说,合成生物学的进步已经产生了一系列概念验证的细菌环,可用于从治疗到生物生产的各种应用。

对于大多数应用,同样的挑战是选择压力的存在,这会导致工程菌的突变率增加。

一种普遍的策略是开发旨在增加单个细胞中有害突变固定时间的克隆技术。

相关论文信息:

●大肠杆菌结构鉴定

耶鲁大学的Jason M. Crawford和Seth B. Herzon研究小组已合作阐明大肠菌素的结构及其与DNA的共存关系。该结果发表在2019年9月6日发布的《科学》中。

研究人员使用遗传学,同位素标记,串联质谱和化学合成来推断大肠菌素的结构。

研究人员解释的结构分配解释了所有已知的生物合成和细胞生物学数据,并提出了未知酶在大肠杆菌基因簇中的作用。

研究人员说,大肠埃希氏菌是一种复杂的次生代谢产物,是由一些具有遗传毒性的肠溶性大肠埃希菌细菌产生的。

产生大肠杆菌的细菌的存在与人类大肠癌的发生频率和严重程度有关。

然而,由于尚未分离或分析大肠杆菌的结构,因此很难研究产大肠杆菌的细菌在人肠道中的生理作用。

相关论文信息:

抗α4β7抗体在SIV感染控制中的疗效评价

美国国立卫生研究院的M. Di Mascio小组进行的一项新研究评估了α4beta 7抗体对猴子免疫缺陷病毒(SIVmac239-nef-stop)感染的控制。研究结果于2019年9月6日发表在国际学术期刊《科学》上。

据报道,用短期抗逆转录病毒疗法(ART)和部分重叠的抗整合素α4β7输入治疗的SIV感染的恒河猴可以在治疗后诱导持久的病毒抑制。

为了重复这些观察,研究人员用相同的病毒,相同的ART和单克隆抗体(mAb,抗alpha 4 beta 7与对照mAb相比)对感染的恒河猴进行了治疗。

测序表明所使用的病毒实际上是SIVmac239-nef-stop,而不是野生型SIVmac239。

感染后两周,发现减毒的Nef-STOP病毒修复为致病性Nef-OPEN的频率与血浆中SIV RNA的水平呈正相关。

在所有治疗中断后,血浆病毒血症水平和α4β7的高表达,以及首次进入抗体之前的CD4阳性T细胞(未用α4β7抗体治疗)的感染前水平与病毒复制水平相关。

随后的血浆病毒血症,外周血CD4阳性T细胞计数以及淋巴结和直肠组织病毒载量在抗a4p7和对照组mAb组之间无显着差异。

相关论文信息:

《科学》

●CRISPR介导的实时成像技术,用于基因组编辑和转录。斯坦福大学的Yan Lei研究小组开发了一种实时成像工具,用于CRISPR介导的基因组编辑和转录。研究结果于2019年9月5日在线发表《科学》。他们报告了一种功能强大的通用工具,称为CRISPR活细胞荧光原位杂交(LiveFISH),该工具使用荧光寡核苷酸对包括原代细胞在内的多种细胞类型进行基因组追踪。 CRISPR定向RNA的固有稳定性使LiveFISH能够准确检测染色体疾病,例如产前羊细胞中的Patau综合征,并追踪人T淋巴细胞中的多个基因座。此外,LiveFISH跟踪由CRISPR-Cas9介导的编辑和随后的染色体易位引起的DNA双链断裂的实时动态。最后,结合Cas9和Cas13系统,LiveFISH可以在活细胞中同时展示基因组DNA和RNA转录本。 LiveFISH方法可在单细胞基因组编辑,转录和重排过程中对DNA和RNA进行实时成像。

相关论文信息:

《科学》:第178卷第6期

●研究发现肠道菌群对抗体反应的影响

抗生素引起的肠道菌群失调改变了人类对疫苗的免疫力。斯坦福大学的Bali Pulendran小组获得了这一结果。相关论文于2019年9月5日发布在《科学》上。

研究人员在季节性流感疫苗接种之前和之后向健康成年人使用了广谱抗生素。尽管肠道细菌负荷降低了10,000倍,细菌多样性继续降低,但抗体反应并未受到明显影响。

但是,在第二项试验中,抗体滴度较低的受试者中,H1N1特异性中和和结合IgG1和IgA反应明显受损。

此外,在这些研究中,抗生素治疗还导致:

(1)老年人的炎症特征(包括AP-1/NR4A表达)增加,树突状细胞激活增加;

(2)不同的代谢轨迹,血清次生胆汁酸减少了1000倍,这与AP-1/NR4A信号传导和炎症体激活高度相关。

多组学整合揭示了细菌物种与代谢表型之间的重要联系,突显了微生物组在调节人类免疫力中的关键作用。

据报道,新出现的证据表明微生物组在免疫中具有重要作用。但是,人类的因果证据很少。

相关论文信息:

●淀粉样蛋白组装激活磷酸酶活性

果蝇胚胎发育中的淀粉样蛋白组装与磷酸酶的活化有关,磷酸酶的活化是美国Stalls医学研究所的Kausik Si研究小组获得的。研究结果发表在2019年9月5日发布的《细胞》上。

研究人员通过果蝇果蝇的多模式筛选鉴定了screening病毒蛋白Herzog(CG5830)。

Herzog充当膜相关的磷酸酶并控制胚胎模式,可能参与TGF-β/BMP和FGF/EGF信号通路。

值得注意的是,Herzog单体没有酶活性,在淀粉样蛋白组装后变得有活性。

Herzog的病毒样结构域对于其组装和膜定位至关重要。

mov病毒样结构域的去除影响活性,而异源病毒样结构域的使用恢复了膜上的装配,并且膜定位的基序能够恢复磷酸酶活性。

这项研究提供了一个a病毒样结构域研究的例子,该研究允许酶通过淀粉样蛋白组装获得基本功能,从而控制动物的发育。

已知病毒蛋白可以在同一细胞中表现出不同的构象和物理状态。序列分析表明病毒蛋白样蛋白在各种物种中普遍存在。然而,它们在多细胞生物中的功能尚不清楚。

相关论文信息:

●研究发现CRISPR转录的关键抑制剂

加拿大多伦多大学的Alan R.Davidson团队发现,抗CRISPR相关蛋白是CRISPR转录的关键抑制剂。该研究报告于2019年9月5日发布在《细胞》上。

他们发现与抗CRISPR蛋白(Acr)相关的启动子在注入噬菌体DNA后立即驱动ACr的高水平转录,并且抗CRISPR基因(aca)蛋白随后抑制了转录。没有ACA活性,这种转录对噬菌体是致命的。

研究表明,感染期间积累足够的Acr蛋白可以抑制宿主细胞中现有的CRISPR-Cas复合物。 ACA蛋白的保守作用可能会降低Acr启动子转录的有害作用。

据报道,噬菌体表达抗CRISPR(Acr)蛋白并抑制了CRISPR-Cas系统,否则该系统会破坏其基因组。大多数Acr基因位于与抗CRISPR相关的基因附近,并编码具有螺旋-角-螺旋-DNA结合基序的蛋白质。

ACA基因的保守性已成为鉴定Acr基因的标志,但尚未研究这些基因编码的蛋白质的功能。

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